More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2911 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  77.73 
 
 
229 aa  367  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  77.73 
 
 
229 aa  364  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 
229 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 
229 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  77.29 
 
 
229 aa  361  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  77.29 
 
 
229 aa  360  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  76.86 
 
 
229 aa  359  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  76.86 
 
 
229 aa  359  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  76.86 
 
 
229 aa  359  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0302  DNA-binding response regulator  76.96 
 
 
230 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  62.67 
 
 
225 aa  300  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  61.78 
 
 
225 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  61.33 
 
 
225 aa  295  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.11 
 
 
228 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3179  DNA-binding response regulator VicR  57.33 
 
 
226 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0255  DNA-binding response regulator  56.89 
 
 
226 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
223 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
223 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
225 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
224 aa  215  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 
224 aa  214  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 
225 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 
256 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 
226 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 
227 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 
237 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
230 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
223 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  44.34 
 
 
223 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  44.34 
 
 
223 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.8 
 
 
228 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 
225 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 
223 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 
219 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
236 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
236 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.22 
 
 
226 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 
230 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 
233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.93 
 
 
235 aa  181  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
233 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 
237 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
227 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
233 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
224 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 
226 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
227 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
233 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  43.17 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 
237 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
227 aa  177  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
233 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  41.74 
 
 
233 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
233 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 
230 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 
230 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
237 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  41.3 
 
 
233 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  42.36 
 
 
237 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 
234 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
237 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 
233 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 
226 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
237 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
233 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 
233 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 
233 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
231 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
228 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 
231 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
232 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
228 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 
231 aa  175  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.46 
 
 
239 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 
227 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 
226 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
232 aa  175  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>