48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5995 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  100 
 
 
310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  93.23 
 
 
310 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  96.13 
 
 
310 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  95.81 
 
 
310 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  93.23 
 
 
310 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  95.81 
 
 
310 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  90.97 
 
 
310 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  72.7 
 
 
308 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  72.7 
 
 
308 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  67.42 
 
 
309 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  65.48 
 
 
311 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  65.48 
 
 
309 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  39.62 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  39.69 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  32.41 
 
 
314 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  32.41 
 
 
314 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  38.91 
 
 
315 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  39.69 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  34.41 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  35.16 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  36.13 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  35.69 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  35.37 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  35.37 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  35.18 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  34.65 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27 
 
 
364 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  32.61 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  32.61 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  32.61 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  32.61 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  32.61 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  27.92 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  32.07 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  32.07 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  32.07 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  32.07 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  30.43 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  30.77 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  32.37 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  31.37 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  36.8 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>