More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6885 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4896  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
255 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0462854  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
258 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
256 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  41.31 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1147  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
295 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
279 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0326  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
279 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
279 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.63 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53721  normal  0.207776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  38.17 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 
281 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 
281 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312689  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  34.75 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959898  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2949  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.16 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  28.36 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2733  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.3 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.83 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.83 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.83 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.33 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1462  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.68 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.759595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1390  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0504  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.07 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  31.27 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2571  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.52 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0716578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0129  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.8 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.33 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.44 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05193  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.31 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00510841  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.44 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.81 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  26.02 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4796  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  27.68 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616684  normal  0.0456615 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  27.76 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  27.56 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283409  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3977  short chain dehydrogenase  27.56 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0505376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.19 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  26.02 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4885  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.83 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726379 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  26.1 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  21.89 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2778  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.63 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24990  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  26.62 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0960196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
263 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  32.43 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  26.24 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  23.88 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.74 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>