241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4211 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  84.97 
 
 		 285 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  50.19 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  52.61 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  49.24 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  53.44 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  46.8 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  45.21 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  44.72 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  45.53 
 
 		 289 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  44.83 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  43.19 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  43.09 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  51.07 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  50.22 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  46.75 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  49.79 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  46.55 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  44.83 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  45.96 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  45.96 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  42.98 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  45.96 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  45.96 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  47.45 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  45.49 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  47.15 
 
 		 287 aa  221  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  43.41 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  44.71 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  43.37 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  46.36 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  44.17 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  46.29 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  50.85 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  44.63 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  49.36 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  40.96 
 
 		 295 aa  215  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  48.5 
 
 		 297 aa  214  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  42.92 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  44.72 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  41.02 
 
 		 274 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  49.39 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  49.16 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  50 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  43.46 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  45.49 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  45.19 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  43.33 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  42.51 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  43.33 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  47.21 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  44.18 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  45.91 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  41.52 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  43.78 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  39.85 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  42.68 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  44.92 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  48.85 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  45.82 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  45.82 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  46.12 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  41.47 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  41.41 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  35.63 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  35.63 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  35.63 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  35.63 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  35.22 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  45.18 
 
 		 186 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  33.75 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  38.02 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  36.84 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  33.62 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  33.19 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  30.32 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  34.35 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  27.82 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  32.14 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  31.28 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  33.98 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  25.61 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.2 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  30.34 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  34.31 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  32.92 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  27.64 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  29.76 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.57 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.49 
 
 		 409 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30.57 
 
 		 419 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  28.45 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  32.49 
 
 		 212 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.88 
 
 		 412 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  29.22 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  31.47 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  30.4 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  31.75 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  27.94 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>