59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4626 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3738  response regulator receiver protein  100 
 
 		 150 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174307  normal  0.0184416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4626  response regulator receiver protein  100 
 
 		 150 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1100  response regulator receiver domain-containing protein  33.8 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0302  response regulator  30.61 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0396154  decreased coverage  0.00000818495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0564  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6521  response regulator receiver protein  28.19 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  normal  0.106404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0543  response regulator receiver domain-containing protein  31.33 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3243  response regulator receiver protein  26.39 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6155  response regulator receiver protein  22.45 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  33.73 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3317  response regulator receiver domain-containing protein  18.92 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.147555  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 226 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3244  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 386 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  25 
 
 		 338 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 228 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 376 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 870 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  27.38 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  28.44 
 
 		 1303 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  30.14 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 121 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4207  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 120 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.771701  normal  0.140814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  38.27 
 
 		 245 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0035  response regulator receiver protein  32.53 
 
 		 120 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  26.51 
 
 		 227 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 230 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 440 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2004  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 478 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 835 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 226 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.11 
 
 		 1053 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 224 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 1344 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1867  DNA-binding transcriptional regulator RstA  37.04 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0435355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1699  DNA-binding transcriptional regulator RstA  37.04 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.205168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1575  DNA-binding transcriptional regulator RstA  37.04 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1643  DNA-binding transcriptional regulator RstA  37.04 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15633  normal  0.900528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1584  DNA-binding transcriptional regulator RstA  37.04 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163508  normal  0.857869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 359 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 465 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000558041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  25 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 234 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 232 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.93 
 
 		 1759 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  30.39 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>