27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2073 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  49.31 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  50.7 
 
 
149 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  38.73 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  43.06 
 
 
150 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  38.52 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  34.07 
 
 
168 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  47.27 
 
 
206 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  47.17 
 
 
199 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  28.08 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  31.4 
 
 
204 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  46.43 
 
 
190 aa  47.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  24.11 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  49.12 
 
 
101 aa  47.4  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  27.85 
 
 
193 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  43.75 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  28.36 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  30.38 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2916  hypothetical protein  33.96 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  38 
 
 
209 aa  43.9  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  43.48 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  37.74 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  44.23 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  44.23 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  39.71 
 
 
196 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>