More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1923 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1923  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 		 196 aa  371  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.869968  normal  0.0208059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12019  methyltransferase  47.67 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  41.61 
 
 		 263 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  42.68 
 
 		 256 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  27.75 
 
 		 261 aa  81.3  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  37.71 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.36 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  26.9 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  24.08 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  25.99 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  24.62 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  27.49 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  29.7 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.48 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  30.3 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  33.54 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.18 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  30.86 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  27.32 
 
 		 322 aa  64.7  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  27.89 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  30.38 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  24.86 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.7 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  31 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  22.86 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.86 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  23.44 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  25.14 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  28.65 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  27.18 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  24.1 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  22.95 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  27.27 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  27.84 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  33.71 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  27.09 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  25.43 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  26.25 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  28.04 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3555  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.23 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.819299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  25.57 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  24.72 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  24.19 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  26.74 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  23.46 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  23.46 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  29.89 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  27.4 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  19.88 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  25.99 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  31.29 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  22.16 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  28.74 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  26.23 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  26.01 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  27.95 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  24.7 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  29.51 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  26.32 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  28.74 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  27.66 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.7 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  23.93 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  26.26 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  21.85 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  23.56 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  27.06 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  26.37 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  28.35 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  28.05 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  25 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  26.84 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  29.09 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  23.12 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  23.12 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>