56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1844 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1844  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
268 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1233  beta-lactamase domain protein  46.1 
 
 
284 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0421  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 
280 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0714  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 
557 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.67 
 
 
333 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  25.19 
 
 
550 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  26.79 
 
 
562 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
544 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
197 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
209 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
218 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 
212 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  23.43 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  25.13 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  27.4 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.23 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  28.35 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.54 
 
 
390 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  18.69 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.95 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  29.95 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  24.73 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
556 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  21.51 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  24.74 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
303 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
231 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.4 
 
 
217 aa  42.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>