37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1829 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  60.74 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  51.87 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  50.41 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  55.14 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  48.35 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  46.72 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  46.28 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  49.79 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  46.19 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  45 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  44.12 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  43.39 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  41.91 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  41.74 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  43.35 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  42.91 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  40.76 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  39.48 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  39.66 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  42.11 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  41.22 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  40.08 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  37.35 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  42.51 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  38.49 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  34.71 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  35.1 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  35.54 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  34.98 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  32.68 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  32.68 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  32.68 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  40 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  30 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  28.02 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  30 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>