More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1286 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 373 aa  731    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  83.89 
 
 		 366 aa  552  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  83.75 
 
 		 361 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  77.39 
 
 		 361 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  70.31 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  69.38 
 
 		 357 aa  498  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  68.82 
 
 		 357 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  70.7 
 
 		 357 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  83.24 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  65.91 
 
 		 356 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  67.82 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  72.07 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  64.94 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  69.48 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  69.66 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  61.97 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  69.25 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  75.71 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  69.37 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  68.97 
 
 		 363 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  67.13 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  62.36 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  65.16 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  62.71 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  65 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  67.27 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  61.5 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  67.43 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  60.57 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  62.15 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  63.27 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  61.37 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.55 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  47.71 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.78 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  49.45 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  53.64 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  45.13 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.14 
 
 		 355 aa  325  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  44.85 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.14 
 
 		 358 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 361 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  48.28 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.4 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 360 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.29 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  44.63 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  44.72 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  47.98 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  48.09 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>