More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0508 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 487 aa  936    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  58.08 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  59.35 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  62.64 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  61.05 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  52.36 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  52.58 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  57.66 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  53.85 
 
 		 518 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  58.1 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  56.26 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  52.49 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  48.13 
 
 		 484 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  50.12 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  49.06 
 
 		 467 aa  339  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  49.06 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  51.01 
 
 		 433 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  49.49 
 
 		 414 aa  297  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  48.84 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  30.34 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  32.33 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  30.39 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  38.5 
 
 		 404 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.6 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  35.52 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.36 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.23 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.51 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.04 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.63 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  40.22 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.15 
 
 		 429 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.99 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.67 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.15 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  35.62 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  33.71 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.06 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.06 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.02 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.08 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.42 
 
 		 406 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  34.92 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.78 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.77 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.73 
 
 		 415 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  35.48 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.32 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.92 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  35.86 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.66 
 
 		 428 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.49 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  35.6 
 
 		 414 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.6 
 
 		 414 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.95 
 
 		 426 aa  203  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.94 
 
 		 406 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  32.9 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.94 
 
 		 418 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.74 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.81 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  37.03 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.72 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  34.45 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 650 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.13 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  32.21 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 405 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  35.45 
 
 		 878 aa  200  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.17 
 
 		 666 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  31.94 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.91 
 
 		 896 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.18 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  33.61 
 
 		 688 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.39 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  33.33 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  34.17 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.49 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.75 
 
 		 941 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.25 
 
 		 885 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  33.33 
 
 		 682 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  29.87 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.51 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.17 
 
 		 880 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.91 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.39 
 
 		 673 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.06 
 
 		 679 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.52 
 
 		 608 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.55 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.23 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.49 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.99 
 
 		 664 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>