More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2987 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2987  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 472 aa  966    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2850  glycoside hydrolase family protein  98.68 
 
 		 453 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  65.45 
 
 		 471 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  65.45 
 
 		 471 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  58.66 
 
 		 443 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  42.09 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  40 
 
 		 458 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  41.55 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  40.59 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  40.94 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  41.89 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  38.88 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  39.51 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  40.56 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  40.26 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  38.78 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  37.45 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  39.81 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  37.64 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38.18 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  37.44 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  41.2 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  39.69 
 
 		 462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  39.87 
 
 		 482 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  38.89 
 
 		 465 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  37.99 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  39.64 
 
 		 448 aa  285  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  37.73 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  38.43 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  38.84 
 
 		 467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  40.05 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  37.3 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  41.44 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  38.39 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  37.05 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  41.71 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  37.61 
 
 		 472 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.84 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  37.61 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  38.36 
 
 		 458 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.67 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  36.01 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  40.05 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  37.42 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  36.49 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  36.93 
 
 		 458 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  37.1 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  39.01 
 
 		 466 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  32.73 
 
 		 446 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  32.88 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  36.96 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  36.89 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  38.25 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  41.15 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  33.26 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  34.17 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  38.23 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  36.93 
 
 		 489 aa  266  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  38.69 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  34.4 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  39.73 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  36.46 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  36.78 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  37.28 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  32.89 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  36.4 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  35.46 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  35.48 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  35.52 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  35.29 
 
 		 457 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  38.8 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  38.27 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  38.91 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  38.49 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  37.79 
 
 		 494 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  38.44 
 
 		 457 aa  253  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  37.89 
 
 		 517 aa  253  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  38.16 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  37.88 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  33.11 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  37.41 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  34.16 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  31.82 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  36.96 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  36.77 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  36.53 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  31.35 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  34.79 
 
 		 482 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  34.82 
 
 		 499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  33.72 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  36.01 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  34.32 
 
 		 494 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  31.79 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  37.2 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  35.67 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  34.29 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  34.25 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  34.97 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>