More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1696 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  100 
 
 		 269 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  49.81 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  48.02 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  46.56 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  41.39 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  42.55 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  40.16 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  44.36 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  42.96 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  46.96 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  43.43 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.75 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  39.15 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  39.84 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  41.7 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  39.75 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  43.15 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  37.26 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  37.14 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.87 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  36.33 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 536 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  35.68 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.62 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.63 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  40.08 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  37.7 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.68 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  37.55 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.68 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.68 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.32 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  38.58 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.27 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  37.4 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  43.29 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  37.22 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.32 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  40 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  32.77 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 490 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  40.49 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.12 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  35.27 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  40.49 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.21 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3978  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.35 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  36.18 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  33.05 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.57 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  40.32 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.86 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  36.44 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  33.59 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2465  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  36.55 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  36.28 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  32.77 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  35.89 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260644 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.4 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.44 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>