38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4103 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  95.75 
 
 		 424 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  67.61 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  67.52 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  57.14 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  64.11 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.22 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.22 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  56.35 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  56.53 
 
 		 419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  56 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  37.84 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  37.84 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  37.39 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  27.71 
 
 		 807 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1410 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  25.93 
 
 		 1085 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  26.5 
 
 		 671 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1200 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.89 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.77 
 
 		 823 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.78 
 
 		 1448 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.41 
 
 		 1212 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1213 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  27.85 
 
 		 675 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1082  putative lipoprotein  31.13 
 
 		 145 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  28.05 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.62 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  21.38 
 
 		 1418 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1718  hypothetical protein  29.46 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.586514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.44 
 
 		 584 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  29.21 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  34.52 
 
 		 1091 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  24.77 
 
 		 1000 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>