28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1312 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  99.72 
 
 
376 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  98.33 
 
 
364 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.86 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.6 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  42.2 
 
 
431 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  36.84 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.45 
 
 
563 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  38.25 
 
 
424 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  37.29 
 
 
424 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  34.57 
 
 
419 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  34.57 
 
 
421 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  34.57 
 
 
420 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  34.57 
 
 
420 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  34.57 
 
 
421 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  34.57 
 
 
421 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  34.57 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  35.57 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  26.8 
 
 
807 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  25.31 
 
 
981 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  31.58 
 
 
675 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.14 
 
 
1448 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  22.17 
 
 
1091 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.26 
 
 
1410 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.11 
 
 
1212 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.03 
 
 
1213 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  29.87 
 
 
671 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  32.24 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>