More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2101 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0885  magnesium chelatase, subunit ChII  99.53 
 
 
427 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0275  putative magnesium-chelatase subunit  99.53 
 
 
427 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1613  magnesium chelatase, subunit ChII  99.53 
 
 
427 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1940  magnesium chelatase, subunit ChII  99.77 
 
 
427 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2101  magnesium chelatase, subunit ChII  100 
 
 
427 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1956  magnesium chelatase, subunit ChII  99.3 
 
 
445 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2406  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  88.7 
 
 
416 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  61.82 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4807  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  62.56 
 
 
358 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  78.7 
 
 
358 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1558  magnesium chelatase  62.81 
 
 
364 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  78.7 
 
 
358 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  74.73 
 
 
357 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  76.73 
 
 
358 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1581  magnesium chelatase  63.3 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  72.79 
 
 
342 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  77.98 
 
 
358 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  58.8 
 
 
340 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  58.99 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  58.99 
 
 
337 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.89 
 
 
335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  57.55 
 
 
333 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5745  magnesium chelatase  67.14 
 
 
386 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.85 
 
 
333 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  55.05 
 
 
342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  55.48 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  53.74 
 
 
594 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  58.55 
 
 
337 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  60 
 
 
336 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  45.82 
 
 
614 aa  276  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.3 
 
 
688 aa  275  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.47 
 
 
616 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.08 
 
 
364 aa  265  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  46.57 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  47.53 
 
 
364 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  47.08 
 
 
346 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.72 
 
 
622 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.72 
 
 
622 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.72 
 
 
622 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.73 
 
 
374 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.13 
 
 
405 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.35 
 
 
369 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.62 
 
 
674 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.04 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.04 
 
 
337 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.88 
 
 
373 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.2 
 
 
337 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  52.12 
 
 
626 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.42 
 
 
357 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  43.93 
 
 
345 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.48 
 
 
336 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.42 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.44 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.12 
 
 
788 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.42 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  45.23 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  45.95 
 
 
334 aa  254  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.15 
 
 
674 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  46.48 
 
 
637 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.34 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.51 
 
 
362 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.81 
 
 
386 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.34 
 
 
362 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.2 
 
 
362 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.81 
 
 
384 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  50.8 
 
 
638 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.95 
 
 
383 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  49.3 
 
 
653 aa  249  9e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.72 
 
 
368 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.81 
 
 
391 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  42.06 
 
 
347 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  43.12 
 
 
362 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  47.84 
 
 
696 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.2 
 
 
362 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.2 
 
 
362 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.2 
 
 
362 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.2 
 
 
362 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.86 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  43.31 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  53 
 
 
629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  42.24 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.34 
 
 
340 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  39.68 
 
 
443 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  44.88 
 
 
314 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  43.63 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  42.49 
 
 
365 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.85 
 
 
665 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.1 
 
 
309 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  52.88 
 
 
618 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  36.3 
 
 
680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  49.28 
 
 
650 aa  239  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.63 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.86 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.36 
 
 
337 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.81 
 
 
386 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  47.57 
 
 
334 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.19 
 
 
370 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  43.4 
 
 
749 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.09 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.39 
 
 
340 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>