More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1016 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 457 aa  933    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  99.78 
 
 		 459 aa  931    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  86 
 
 		 457 aa  785    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  71.12 
 
 		 456 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 456 aa  589  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 		 449 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  56.86 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  52.21 
 
 		 445 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 447 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 441 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 440 aa  395  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 881 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 477 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 465 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 481 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 508 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 482 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 488 aa  246  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 512 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 481 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 483 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 486 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 491 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 469 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 481 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>