35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1804 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  99.66 
 
 
293 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  85.12 
 
 
293 aa  484  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  35.99 
 
 
303 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  32.73 
 
 
316 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  34.1 
 
 
304 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  31.01 
 
 
302 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  35.64 
 
 
300 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  33.68 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  27.14 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  26.13 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
307 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  27.51 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  28.82 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.2 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  25.37 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  21.82 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.75 
 
 
379 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  25.65 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  22.81 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.52 
 
 
335 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  24.41 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  21.17 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  25.27 
 
 
314 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  29.41 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  26.67 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>