More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_2178 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  96.93 
 
 
391 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  100 
 
 
416 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  96.68 
 
 
423 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  93.09 
 
 
423 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  100 
 
 
384 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  97.19 
 
 
391 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  100 
 
 
384 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  81.84 
 
 
403 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  81.84 
 
 
403 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  81.84 
 
 
403 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  79.74 
 
 
403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.79 
 
 
403 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.53 
 
 
403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  79.74 
 
 
403 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  74.08 
 
 
400 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  70.66 
 
 
400 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  61.2 
 
 
390 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  60.38 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  51.05 
 
 
383 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.34 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.59 
 
 
395 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  44.69 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.76 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.01 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  44.76 
 
 
394 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  44.5 
 
 
394 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.34 
 
 
395 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  43.52 
 
 
395 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  42.41 
 
 
394 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.04 
 
 
395 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.65 
 
 
393 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.29 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  40.28 
 
 
392 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.65 
 
 
396 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  38.65 
 
 
396 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.65 
 
 
396 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  38.28 
 
 
417 aa  230  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.77 
 
 
375 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.34 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.17 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  40.36 
 
 
402 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.32 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
412 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
412 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
412 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
412 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.41 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.89 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.41 
 
 
412 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  36.18 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  34.93 
 
 
412 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.93 
 
 
412 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.67 
 
 
412 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  34.92 
 
 
414 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.59 
 
 
412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.08 
 
 
395 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  35.29 
 
 
364 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  36.06 
 
 
405 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  35.77 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.77 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.35 
 
 
403 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.66 
 
 
433 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.51 
 
 
425 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.53 
 
 
407 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  33.25 
 
 
401 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.9 
 
 
399 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.51 
 
 
424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  34.54 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.51 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.25 
 
 
413 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.16 
 
 
393 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  35.16 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.68 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.81 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  29.84 
 
 
422 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  34.28 
 
 
411 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.68 
 
 
419 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  33.42 
 
 
411 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.38 
 
 
397 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.71 
 
 
440 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.08 
 
 
416 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.68 
 
 
413 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 
393 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  32.89 
 
 
413 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  33.15 
 
 
411 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.98 
 
 
413 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.68 
 
 
418 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.12 
 
 
415 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.4 
 
 
412 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  30.86 
 
 
414 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
420 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.06 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.11 
 
 
410 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  32.43 
 
 
440 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.45 
 
 
417 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.75 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.39 
 
 
410 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>