217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0985 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
430 aa  867    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  54.37 
 
 
332 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  50.96 
 
 
331 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  48.29 
 
 
321 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  48.73 
 
 
303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  45.18 
 
 
315 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
329 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  46.5 
 
 
303 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
307 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 
303 aa  156  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
317 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
317 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  44.08 
 
 
319 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  46.89 
 
 
314 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  41 
 
 
358 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  42.65 
 
 
321 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 
316 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  44.89 
 
 
325 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 
392 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
341 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
327 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 
327 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  39.91 
 
 
321 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  46.34 
 
 
326 aa  146  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  40.77 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  43.43 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  42.79 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  41.51 
 
 
308 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  41.15 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  41.15 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  41.15 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
314 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
319 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  40.09 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  43.55 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  46.99 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
293 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  39.18 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
331 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 
352 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  41.15 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11390  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  45.54 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  40.84 
 
 
325 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
318 aa  131  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  40.38 
 
 
308 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  38.69 
 
 
282 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  36.09 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  40.29 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
310 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
301 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  37.43 
 
 
319 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
319 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
319 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  35.16 
 
 
348 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
342 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  40.33 
 
 
305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
305 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
261 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
262 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
278 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  37.93 
 
 
474 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  37.71 
 
 
258 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  37.43 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  35.41 
 
 
280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 
315 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  37.14 
 
 
257 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  36.57 
 
 
257 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
271 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  33.05 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  36.57 
 
 
257 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
319 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>