54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4587 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  357  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  47.22 
 
 		 209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  43.17 
 
 		 228 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  47.25 
 
 		 225 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  44.69 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  39.01 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  43.78 
 
 		 315 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  43.85 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  46.74 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  42.61 
 
 		 208 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  43.32 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  44.51 
 
 		 223 aa  111  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  39.34 
 
 		 446 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  39.77 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  40.33 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  39.33 
 
 		 289 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  36.93 
 
 		 209 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  34.78 
 
 		 210 aa  100  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  38.76 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  41.44 
 
 		 252 aa  98.6  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  37.02 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  37.43 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  38.29 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  36.16 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  35.26 
 
 		 300 aa  92  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  34.97 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  35.8 
 
 		 312 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  36.22 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  38.66 
 
 		 231 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  36.41 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  32.09 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  37.99 
 
 		 289 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  32.99 
 
 		 257 aa  84.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  38.33 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  31.41 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  33.89 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  32.6 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  37.95 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  36.51 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  38.51 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  37.42 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  35.87 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  31.61 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  31.35 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  28.65 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  30.85 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  32.62 
 
 		 389 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>