248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4263 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3222  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0490977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.45 
 
 
129 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.98 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.57 
 
 
129 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  37.74 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.74 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.74 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.21 
 
 
121 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2731  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.18 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20873  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.44 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.2 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.64 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0534  Rieske (2Fe-2S) region  38.39 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.69 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  30.19 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  32.43 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 
112 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.61 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.12 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.61 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  34.04 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0985  Rieske (2Fe-2S) region  32.71 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.750027  hitchhiker  0.00017635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.18 
 
 
374 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  31.48 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.97 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  29.73 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  36.19 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  31.87 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.73 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
322 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  37.08 
 
 
656 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2594  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.86 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  33.02 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.93 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.69 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.71 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  29 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  32.14 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.14 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2840  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33.63 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.41626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  30.1 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.25 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  31.78 
 
 
127 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
141 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.66 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01974  benzene 1,2-dioxygenase ferredoxin protein  29.36 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.73 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  34.18 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.13 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.57 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.01 
 
 
518 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.2 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.55 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  28.97 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  28.97 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2329  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.74 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  29.13 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  29.13 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.13 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.08 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1318  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  30 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  28.85 
 
 
289 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  27.36 
 
 
270 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.78 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  28.43 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.16 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  27.34 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  27.34 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.43 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1553  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.68 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  29.9 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.97 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  28.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1701  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.84 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104071  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
438 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  35.62 
 
 
445 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 
398 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>