More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3457 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  100 
 
 		 342 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 		 393 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  31.66 
 
 		 395 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3083  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  34.46 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  29.94 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0652  histidinol-phosphate aminotransferase  35.4 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  34.67 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  32.42 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  34.04 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  33.13 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.71 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  31.46 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  28.88 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  36.14 
 
 		 372 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  30.22 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  35.1 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  29.06 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  30.42 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0635  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0630  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 		 366 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 379 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1984  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1981  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  29.6 
 
 		 366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  29.6 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  29.6 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2648  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  29.6 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  28.06 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.05 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  34.06 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  34.11 
 
 		 356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 		 380 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  34.15 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  30.65 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  27.49 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.22 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1423  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.65 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0694  histidinol-phosphate aminotransferase  33.95 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  31.89 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.8 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  33.83 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  32.21 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>