48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3376 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3376  putative thiol-disulfide oxidoreductase  100 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2757  putative thiol-disulfide oxidoreductase  37.76 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  33.01 
 
 		 210 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 238 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  33 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  26.85 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.91 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.85 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  30.1 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  27.36 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  30.28 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  28.72 
 
 		 191 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.88 
 
 		 203 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  29.81 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  30.3 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  26.67 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  28.85 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.63 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  27.36 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  22.12 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  25.47 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  27.78 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  28.16 
 
 		 213 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  34.04 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  23.08 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  25.47 
 
 		 194 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  28.16 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  28.7 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  26.85 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  29.13 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  29.81 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.04 
 
 		 202 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  28.3 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  24.53 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  28.72 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>