234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02222 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  100 
 
 		 881 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02222  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  96.98 
 
 		 881 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  94.63 
 
 		 880 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  94.97 
 
 		 881 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  94.97 
 
 		 880 aa  584  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  89.23 
 
 		 860 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  79.6 
 
 		 882 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  55.41 
 
 		 885 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  55.07 
 
 		 885 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  55.07 
 
 		 885 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  54.39 
 
 		 885 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  53.04 
 
 		 881 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  54.82 
 
 		 881 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  54.49 
 
 		 881 aa  321  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  54.49 
 
 		 881 aa  321  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  59.39 
 
 		 844 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  58.46 
 
 		 846 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.76 
 
 		 835 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  40 
 
 		 826 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.62 
 
 		 826 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  39.62 
 
 		 826 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.61 
 
 		 828 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.79 
 
 		 845 aa  178  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.71 
 
 		 819 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  32.71 
 
 		 833 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  32.33 
 
 		 816 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  32.33 
 
 		 816 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  32.33 
 
 		 833 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  32.33 
 
 		 833 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  37.09 
 
 		 829 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  33.96 
 
 		 830 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.96 
 
 		 832 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  36.73 
 
 		 829 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  36.73 
 
 		 829 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.71 
 
 		 818 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  36.36 
 
 		 829 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  36.36 
 
 		 829 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.21 
 
 		 832 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  32.84 
 
 		 833 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  33.21 
 
 		 834 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  32.84 
 
 		 812 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.84 
 
 		 821 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  32.84 
 
 		 822 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  31.8 
 
 		 792 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.97 
 
 		 828 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.34 
 
 		 828 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.97 
 
 		 828 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.97 
 
 		 828 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.97 
 
 		 828 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.11 
 
 		 829 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.97 
 
 		 817 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  31.23 
 
 		 813 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.23 
 
 		 813 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  31.23 
 
 		 813 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  31.23 
 
 		 813 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  31.5 
 
 		 820 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  35.47 
 
 		 836 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  35.47 
 
 		 836 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  35.47 
 
 		 836 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  34.88 
 
 		 836 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.65 
 
 		 876 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  31.16 
 
 		 833 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  30.9 
 
 		 850 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  30.9 
 
 		 833 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  30.9 
 
 		 833 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33 
 
 		 850 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  28.29 
 
 		 839 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  32.56 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.32 
 
 		 877 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  32.56 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  32.56 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  32.56 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  32.56 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.12 
 
 		 859 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4914  outer membrane usher protein FimD, truncation  32.26 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.47 
 
 		 861 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  29.59 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  32.54 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  31.95 
 
 		 878 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  30.05 
 
 		 873 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.95 
 
 		 878 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  30.05 
 
 		 888 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  31.95 
 
 		 878 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.05 
 
 		 888 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  31.95 
 
 		 863 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  31.95 
 
 		 878 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01463  hypothetical protein  28.99 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2141  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.99 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000830223  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  30.05 
 
 		 888 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01475  hypothetical protein  28.99 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.690608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1589  fimbrial usher family protein  28.99 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  29.53 
 
 		 888 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  29.59 
 
 		 871 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2152  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.99 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.54 
 
 		 867 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.4 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  28.4 
 
 		 838 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.4 
 
 		 838 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  28.4 
 
 		 838 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>