263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00667 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  100 
 
 		 816 aa  1635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  98.11 
 
 		 818 aa  1609    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  97.22 
 
 		 819 aa  1554    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  83.96 
 
 		 816 aa  1416    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.04 
 
 		 832 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  41.16 
 
 		 830 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  97.22 
 
 		 833 aa  1554    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  96.97 
 
 		 833 aa  1544    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  97.47 
 
 		 833 aa  1556    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.95 
 
 		 832 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  39.95 
 
 		 833 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  39.45 
 
 		 822 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.39 
 
 		 821 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  39.45 
 
 		 834 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  39.39 
 
 		 812 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  40.4 
 
 		 829 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  40.15 
 
 		 829 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  40.15 
 
 		 829 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  40.15 
 
 		 829 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  40.02 
 
 		 829 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.42 
 
 		 835 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.61 
 
 		 844 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.5 
 
 		 846 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  37.15 
 
 		 885 aa  519  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  37.03 
 
 		 885 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  37.03 
 
 		 885 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  37.03 
 
 		 885 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  36.18 
 
 		 826 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.18 
 
 		 826 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.59 
 
 		 828 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  36.18 
 
 		 826 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  34.67 
 
 		 880 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.25 
 
 		 845 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  35.09 
 
 		 860 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  34.39 
 
 		 881 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  34.87 
 
 		 880 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  35.56 
 
 		 881 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  35.56 
 
 		 881 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.26 
 
 		 881 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  35.44 
 
 		 881 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  35.44 
 
 		 881 aa  492  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  34.59 
 
 		 882 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  34.1 
 
 		 881 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.84 
 
 		 828 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.73 
 
 		 817 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.46 
 
 		 828 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.5 
 
 		 828 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.25 
 
 		 829 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.34 
 
 		 828 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.34 
 
 		 828 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 		 813 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  33.13 
 
 		 813 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  33.13 
 
 		 813 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  33 
 
 		 813 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  35.02 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  29.22 
 
 		 820 aa  319  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.33 
 
 		 837 aa  303  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  30.22 
 
 		 851 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.79 
 
 		 840 aa  286  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.31 
 
 		 850 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  29.77 
 
 		 833 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  29.4 
 
 		 833 aa  280  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  28.94 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  29.67 
 
 		 863 aa  277  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  28.66 
 
 		 863 aa  276  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.42 
 
 		 838 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  29.42 
 
 		 838 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.54 
 
 		 838 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  29.42 
 
 		 838 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  30.97 
 
 		 844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  29.15 
 
 		 842 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  29.42 
 
 		 838 aa  275  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.2 
 
 		 877 aa  274  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  28.64 
 
 		 809 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  28.64 
 
 		 809 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  28.82 
 
 		 878 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.82 
 
 		 878 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  28.82 
 
 		 878 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  28.64 
 
 		 809 aa  273  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  29.02 
 
 		 842 aa  273  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  28.64 
 
 		 809 aa  273  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  29.59 
 
 		 838 aa  273  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  29.02 
 
 		 842 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.32 
 
 		 851 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  28.52 
 
 		 809 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  28.64 
 
 		 878 aa  271  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  28.69 
 
 		 856 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  28.62 
 
 		 870 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.62 
 
 		 870 aa  267  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.46 
 
 		 869 aa  267  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.74 
 
 		 884 aa  267  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  29.28 
 
 		 914 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  28.66 
 
 		 839 aa  267  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  28.46 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  29.16 
 
 		 913 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  28.46 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  28.13 
 
 		 833 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  29.11 
 
 		 840 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  28.2 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>