299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t04  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0090  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0008  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0075  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0021  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0042  tRNA-Met  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0010  tRNA-Met  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0028  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.260556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0031  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0028  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882337  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  93.88 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna2  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.119286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0043  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.538604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0058  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0021  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.715825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0057  tRNA-Met  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0003  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04914  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42096  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.269889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0032  tRNA-Lys  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2668  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0004  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000188757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0968  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0809  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2409  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0639  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0025  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0688964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0002  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584734  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0805  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0410  hypothetical protein  90.7 
 
 		 282 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0022  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0015  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0103939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>