35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  52.5 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  50.65 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  47.89 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  35.71 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  45 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.46 
 
 		 392 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  39.08 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  41.03 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  39.02 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  36.78 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  36.67 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  34.83 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  44.29 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  34 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  31.96 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  34.69 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  42.19 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00129  hypothetical protein  36.59 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  34.07 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  42.19 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  42.19 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  42.19 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  31.34 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  34.74 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  39.47 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  42.19 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  42.19 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  40.62 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1516  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00121071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  37.65 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  40.62 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>