37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3385 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  90.91 
 
 		 77 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  44.74 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  38.3 
 
 		 214 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  48.09 
 
 		 485 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  38.5 
 
 		 1461 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  46.21 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  42.42 
 
 		 237 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  40.77 
 
 		 839 aa  85.9  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  39.06 
 
 		 153 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1227 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  42.62 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  38.89 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  42.27 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  30.39 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  32.82 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  26.54 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  31.06 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  32.67 
 
 		 119 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  33.56 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  30.83 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  30.93 
 
 		 129 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  28.27 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  30.82 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0702  hypothetical protein  27.74 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  30.39 
 
 		 130 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>