More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1537 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  84 
 
 		 275 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  83.27 
 
 		 275 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  82.18 
 
 		 274 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  68.75 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  68.38 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  68.38 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  68.01 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  66.18 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  62.59 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  62.95 
 
 		 296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  58.76 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 		 280 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  62.32 
 
 		 292 aa  331  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  63.18 
 
 		 282 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  62.04 
 
 		 283 aa  331  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 286 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  61.31 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  61.73 
 
 		 287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  61.37 
 
 		 287 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  62.59 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  59.78 
 
 		 288 aa  322  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  58.12 
 
 		 286 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  60.29 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 		 287 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  61.01 
 
 		 287 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  59.35 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  59.5 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  56.68 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  59.14 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 		 297 aa  315  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  58.89 
 
 		 281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  59.26 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  57.09 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  55.19 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  57.56 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  55.89 
 
 		 275 aa  272  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  55.15 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  51.08 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  40.39 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  38.68 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  43.23 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36.46 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  36.56 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  34.47 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  35.87 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  34.63 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  40.46 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  34.52 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  40.55 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  37.75 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>