More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4457 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4457  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
674 aa  1383    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0954  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63.81 
 
 
677 aa  893    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
792 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 
1274 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 
1172 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  32.51 
 
 
919 aa  119  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
650 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1159 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
1645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
470 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2255  histidine kinase  33.04 
 
 
474 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000178089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1168 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1383 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
1143 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
901 aa  114  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
1711 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  29.32 
 
 
370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 
757 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
1038 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1163 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
1651 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
1048 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1177 aa  110  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  30.96 
 
 
424 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
676 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30 
 
 
1514 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 
1550 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
1426 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
1646 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
444 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0355  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
459 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
456 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30 
 
 
1514 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1158 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 
853 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
903 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1155 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  31.54 
 
 
1361 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
472 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  30.54 
 
 
1137 aa  108  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1362 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3790  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
689 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296529  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
1415 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
484 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1037 aa  107  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
484 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
484 aa  107  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  26.15 
 
 
1427 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
590 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.25 
 
 
484 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  29.43 
 
 
576 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
381 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
387 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
484 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.13 
 
 
456 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
458 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.04 
 
 
484 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
458 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.04 
 
 
484 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.89 
 
 
458 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1155 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  31.51 
 
 
575 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
458 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
458 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
458 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.63 
 
 
508 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  26.67 
 
 
908 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
458 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
1137 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
458 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 
763 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 
763 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
456 aa  104  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
728 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
458 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
592 aa  104  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
612 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
458 aa  104  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
754 aa  104  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  32.17 
 
 
1170 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
489 aa  103  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.14 
 
 
484 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1155 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1149  histidine kinase  29.88 
 
 
471 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  30.82 
 
 
1346 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
581 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
944 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
1631 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
1917 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1322 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1842  histidine kinase  27.61 
 
 
324 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  28.57 
 
 
1074 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
844 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
844 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2524  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
751 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
767 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2158  histidine kinase  28.52 
 
 
536 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
571 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1847 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>