46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3605 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 450 aa  922    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  52.48 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  49.89 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  50.56 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  51 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  51.02 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  50.45 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  48.99 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  50 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  50.23 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  50 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  50 
 
 		 446 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  50 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  51.02 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  48.65 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  50.91 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  50.34 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  49.21 
 
 		 455 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  34.22 
 
 		 430 aa  213  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  31.47 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.63 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  31.07 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  31.07 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  30.84 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  31.31 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  29.81 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  32.24 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  31.58 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  32.56 
 
 		 437 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  27.8 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  31.17 
 
 		 449 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  31.45 
 
 		 424 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.54 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  32.02 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  30.48 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 441 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.24 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  28.35 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  28.35 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.4 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  27.91 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  28.44 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.75 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  22.54 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>