More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0214 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  100 
 
 		 329 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  88.92 
 
 		 325 aa  570  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  73.4 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  70.37 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  73.97 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  73.2 
 
 		 330 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  71.38 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  68.4 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  68.71 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  69.97 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  70.72 
 
 		 317 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  64.17 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  66.14 
 
 		 319 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  68.11 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  71.66 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  61.88 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  66.45 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  62.03 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  69.87 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  67.64 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  64.38 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  68.21 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  63.78 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  64.44 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  63.78 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  60.19 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  63.78 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  63.23 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  62.7 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  63.23 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  59.16 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  67.77 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  62.71 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  61.61 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  61.02 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  64.63 
 
 		 317 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  62.1 
 
 		 327 aa  361  8e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  63.78 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.68 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  58.14 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  59.93 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.79 
 
 		 314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.79 
 
 		 314 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.55 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.59 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 311 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.4 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  54.79 
 
 		 314 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  54.95 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  51.62 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.28 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  51.61 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 460 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 323 aa  312  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  51.41 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.18 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.67 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  51.41 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.82 
 
 		 332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  50.78 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  49.37 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.64 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  48.29 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  52.35 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  51.3 
 
 		 313 aa  301  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 322 aa  301  9e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  48.51 
 
 		 314 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  48.39 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.37 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 461 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 461 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  51.58 
 
 		 325 aa  298  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  47.59 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  48.4 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  53.47 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  53.51 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.96 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 335 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  51.16 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  47.71 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  47.42 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  50 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  50 
 
 		 317 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  47.52 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  46.6 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  51.48 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>