More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0053 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  54.33 
 
 		 316 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  52 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  45.27 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  44.77 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  42.67 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  42.67 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  42.67 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  42.62 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  42 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  42.11 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  40.49 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  42.95 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  40.33 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  42.3 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  37.91 
 
 		 334 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  39.32 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  40.85 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  38.46 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  39.14 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  38.54 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  36.63 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  37.5 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  35.94 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  33.98 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  33.84 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  34.59 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  33.67 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  32.9 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  31.76 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  31.7 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  31.92 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.9 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  30.86 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  31.63 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  41.06 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  32.9 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  31.63 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  30.31 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  32.8 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.34 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  31.09 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.87 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  30.35 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  33.96 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  31.63 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  32.18 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.48 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  26.11 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.33 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  31.55 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.36 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  31.45 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.38 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  32.54 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  31.09 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  29.77 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  30.71 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.27 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.01 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  30.91 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.62 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.21 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  30.26 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  32.09 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  28.95 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.57 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  25.89 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  26.52 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.08 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.97 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>