More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0926 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  62.14 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  60 
 
 		 99 aa  117  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  51.96 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  54.9 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.02 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  58 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  48.04 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  103  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>