More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1320 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  215  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  49.02 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  54.29 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  46.15 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  51.49 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  51.43 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  47.06 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  51.55 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  53.19 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  48.04 
 
 		 223 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.58 
 
 		 106 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  48.48 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  49.02 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  50.51 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.49 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  48 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  46.08 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  45.37 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  45.19 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  45.63 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  45.63 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.3 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  44.55 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  48.42 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  46.53 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  48.45 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  45.36 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  54.44 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.76 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  44.44 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  43.81 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  48.04 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  48.04 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.87 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.87 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  44.44 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  45.63 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  49.49 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  43.69 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  47.12 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  45.74 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  47.42 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  47 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  50.54 
 
 		 259 aa  103  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  43.56 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  49.5 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.31 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  45.36 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  44.12 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  42.72 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  46.08 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  45.83 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>