239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0146 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  60.29 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  53.44 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  46.53 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  49.28 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  48.55 
 
 		 132 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  47.1 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  47.83 
 
 		 132 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 132 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  43.38 
 
 		 142 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 131 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  45.11 
 
 		 132 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  40.46 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  45.11 
 
 		 132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  45.52 
 
 		 130 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  42.11 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  41.79 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  46.15 
 
 		 132 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  39.71 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  45.24 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  42.03 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  47.01 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  42.54 
 
 		 131 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 131 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  43.18 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 138 aa  104  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  51.02 
 
 		 136 aa  101  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  48.87 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  48.12 
 
 		 129 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  36.64 
 
 		 128 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  48.06 
 
 		 143 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  45.11 
 
 		 129 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 135 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  45.11 
 
 		 129 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  42.96 
 
 		 139 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  51.89 
 
 		 129 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  51.02 
 
 		 388 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 132 aa  95.9  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 132 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  41.35 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  40.74 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 133 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 127 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  46.46 
 
 		 129 aa  92  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  42.76 
 
 		 151 aa  91.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  39.1 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  46.43 
 
 		 129 aa  90.9  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 139 aa  90.9  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  38.97 
 
 		 131 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  45.74 
 
 		 142 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  46.72 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  46.62 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04940  cytidine deaminase, putative  43.41 
 
 		 138 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0896337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  46.4 
 
 		 120 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  46.61 
 
 		 135 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 136 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 134 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  38.69 
 
 		 140 aa  88.2  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2461  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 132 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  38.85 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  38.85 
 
 		 135 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  39.1 
 
 		 129 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 138 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  45.83 
 
 		 136 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.11 
 
 		 582 aa  85.9  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  38.64 
 
 		 130 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 129 aa  84.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  35.34 
 
 		 139 aa  84.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  43.2 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  45.61 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>