69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1484 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  691    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  37.16 
 
 		 321 aa  159  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  27.55 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  35.42 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  27.52 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  33.03 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  23.26 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  28.83 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  32.2 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  24.06 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  30.23 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  29.73 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  30.33 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  27.13 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  30.51 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  29.46 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  29.46 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  24.29 
 
 		 179 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.78 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.36 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 600 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  25 
 
 		 705 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  26.23 
 
 		 623 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.23 
 
 		 471 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.83 
 
 		 810 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  25.55 
 
 		 531 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2461  hypothetical protein  26.38 
 
 		 435 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  24.32 
 
 		 596 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  22.93 
 
 		 705 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.14 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  21.54 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.14 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.14 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  26.06 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.19 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.25 
 
 		 567 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.25 
 
 		 567 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  24.14 
 
 		 661 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  28.43 
 
 		 839 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.97 
 
 		 606 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  21.32 
 
 		 536 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  24.14 
 
 		 148 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  26.7 
 
 		 504 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  29.47 
 
 		 549 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.7 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  27.84 
 
 		 611 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  26.5 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  24.49 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  25 
 
 		 692 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.7 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.7 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.37 
 
 		 583 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 		 602 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  24.34 
 
 		 604 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  25.97 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  28.72 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  28.44 
 
 		 642 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  23.36 
 
 		 590 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  24.53 
 
 		 157 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.37 
 
 		 583 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.69 
 
 		 565 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  24.55 
 
 		 605 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  24.76 
 
 		 552 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1444  hypothetical protein  24.17 
 
 		 130 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00624852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  23.81 
 
 		 161 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>