More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0507 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0876  ATP synthase F1, gamma subunit  43.21 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.39 
 
 
287 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.4 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.74 
 
 
287 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.06 
 
 
287 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  38.38 
 
 
285 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  40 
 
 
295 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  38.36 
 
 
309 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.73 
 
 
283 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.16 
 
 
288 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
288 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 
286 aa  185  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
316 aa  185  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
315 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  35.67 
 
 
315 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 
286 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
314 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
286 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
286 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.57 
 
 
295 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.54 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  39.26 
 
 
285 aa  178  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  38.59 
 
 
288 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.92 
 
 
289 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 
290 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  35.76 
 
 
308 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 
288 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 
286 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  38.26 
 
 
285 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 
291 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.92 
 
 
286 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.83 
 
 
290 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 
286 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
288 aa  175  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.76 
 
 
315 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 
286 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.67 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.67 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.1 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.16 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.22 
 
 
290 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.75 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.76 
 
 
291 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.75 
 
 
290 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.99 
 
 
287 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37 
 
 
289 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37 
 
 
289 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  36.95 
 
 
287 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.03 
 
 
289 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.91 
 
 
286 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
286 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.91 
 
 
287 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
294 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 
288 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
291 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
291 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 
288 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 
287 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 
289 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 
288 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
294 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
293 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.25 
 
 
291 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
298 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.84 
 
 
288 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 
295 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.79 
 
 
286 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
291 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.84 
 
 
288 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  36.27 
 
 
291 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.43 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.92 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  36.72 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 
291 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
291 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
291 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.59 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  35.62 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.01 
 
 
316 aa  165  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 
287 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 
287 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 
287 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>