92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0340 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0340  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
155 aa  327  5.0000000000000004e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953733 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  30.14 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.77 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.77 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  31.09 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  31.53 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  31.53 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.82 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.46 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  25.69 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.48 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  30.97 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  25.88 
 
 
173 aa  60.5  0.000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.48 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.27 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  28.93 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.38 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.58 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.03 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.39 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.48 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  27.33 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.85 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  28.08 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  31.15 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.15 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  33.63 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.65 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.93 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.86 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  28.48 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  28.48 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  29.8 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.2 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  28.48 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  29.14 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.97 
 
 
146 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.59 
 
 
570 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.41 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  30.77 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  30.77 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  35.11 
 
 
341 aa  50.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  29.79 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  30.99 
 
 
273 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  30.43 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  27.7 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.25 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.17 
 
 
148 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  26.97 
 
 
151 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  31.65 
 
 
162 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1865  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25 
 
 
488 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.88 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.77 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  34.31 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  29.29 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.04 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.06 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.2 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  29.29 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0139  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.38 
 
 
591 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  29.63 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.57 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.57 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  28.1 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.62 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.66 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0119  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  26.63 
 
 
489 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  30.43 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.78 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.36 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.9 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3412  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.78 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234898  hitchhiker  0.00117698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.13 
 
 
144 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  26.96 
 
 
146 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.49 
 
 
504 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520154  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.4 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.07 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.4 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  28.47 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.47 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.24 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  23.97 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3614  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.88 
 
 
503 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.81 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>