96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3412 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3412  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 144 aa  299  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234898  hitchhiker  0.00117698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3571  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.36 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3657  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.97 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.28 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3945  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3277  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0078  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.01 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05385  deoxycytidylate deaminase  38.78 
 
 		 168 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0956  putative cytidine and deoxycytidylate deaminase  36.17 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0395  putative deoxycytidylate deaminase  37.67 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000505  deoxycytidylate deaminase  36.24 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  37.9 
 
 		 173 aa  76.6  0.00000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2482  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.13 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000398505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3746  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.43 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.3 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl385  deoxycytidylate deaminase  35.71 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.372147  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9348  predicted protein  36.62 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0397  deoxycytidylate deaminase  36.19 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.496009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.8 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.8 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  36 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  36.63 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00700  deoxycytidylate deaminase  32.17 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.83 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.81 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.62 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.21 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  32.81 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.93 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.38 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  32 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.97 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.03 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.16 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1200  deoxycytidylate deaminase-like protein  29.01 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0197  deoxycytidylate deaminase-like protein  29.01 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.754602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.93 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.57 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  35.64 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.93 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  35.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.87 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.69 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  31.76 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.76 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.36 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.56 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.58 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.67 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.09 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.08 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.34 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  31.25 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  35 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  34.04 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  34.29 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.71 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  29.69 
 
 		 341 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  31.78 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.78 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.96 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  41.25 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.66 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0340  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.78 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  32.65 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.18 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.41 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  29.05 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  40 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.7 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  34.45 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  34.45 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  34.45 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  34.45 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  34.45 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  34.45 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.13 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  38.46 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.93 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  31.4 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  35.56 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  35.56 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  28.67 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  33.61 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.56 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  33.61 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  33.61 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.3 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  33.93 
 
 		 151 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32 
 
 		 173 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>