294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0275 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  36.61 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  40.7 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  45.07 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  50.7 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  35.64 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  46.75 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  35.64 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  44.16 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  39 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.83 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  46.67 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  39.62 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  35.64 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  32.67 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  33.96 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  37.35 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  45.33 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  35.9 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  32.35 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  45.33 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  45.33 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  37.18 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  40.51 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  42.47 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.1 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.1 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
120 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  36 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  36.26 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  36.99 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  38.36 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  32.69 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1576  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  38.36 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  36.71 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  35.62 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  33.33 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  37.33 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  34.95 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  34.34 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  34.34 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  34.95 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  36.7 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  33.72 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  37.66 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  37.66 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  34.74 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  44 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  45.71 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>