More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5734 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  49.88 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  49.88 
 
 		 423 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  57.54 
 
 		 436 aa  401  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  49.04 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  48.01 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  48.57 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  50 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  51.1 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  49.52 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  50.37 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 420 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 428 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 427 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  46.1 
 
 		 429 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 415 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 415 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  46.96 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 		 419 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  42.36 
 
 		 445 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  42.36 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  45.52 
 
 		 424 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 424 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  43.34 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  43.61 
 
 		 474 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 419 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  42.92 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  43.15 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  43.15 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 421 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  43.93 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  42.69 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  43.93 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  42.41 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  43.92 
 
 		 398 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  43.92 
 
 		 398 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  43.92 
 
 		 398 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 428 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 415 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  34 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  35.93 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.19 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.64 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  31.92 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  32.17 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  30.83 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>