48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5256 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 194 aa  361  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.53 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  39.02 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  37.9 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  30.41 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12572  hypothetical protein  42.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000763367  normal  0.175513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  36.88 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  48.72 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  48.72 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  48.72 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  35.48 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  39.02 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  38.46 
 
 		 275 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  33.96 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  43.82 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  32.28 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  35.76 
 
 		 296 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  29.69 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  32.54 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  35.23 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  31.25 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  50.68 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  43.75 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.35 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.84 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  34.53 
 
 		 268 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  27.97 
 
 		 254 aa  45.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.27 
 
 		 259 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  41.94 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.51 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  40 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0458  prepilin peptidase  29.89 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  31.34 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  28.24 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.4 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  26.58 
 
 		 255 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  27.89 
 
 		 253 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 		 280 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  31.85 
 
 		 304 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.27 
 
 		 287 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  29.93 
 
 		 250 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.27 
 
 		 287 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  35.92 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  31.58 
 
 		 246 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  31.85 
 
 		 308 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>