More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0593 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0593  aminotransferase class V  100 
 
 		 389 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  64.91 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  43.96 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  42.89 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  42.82 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.63 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.63 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.15 
 
 		 398 aa  272  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.03 
 
 		 1143 aa  272  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.49 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.06 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  41.05 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  40.47 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  40.52 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  40.73 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.96 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  41.3 
 
 		 404 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  43.32 
 
 		 436 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  43.32 
 
 		 436 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.04 
 
 		 1139 aa  262  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  41.1 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  41.86 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 404 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  38.64 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  43.41 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.33 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.89 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.33 
 
 		 407 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  43.72 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.23 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  38.38 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.32 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  41.32 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  44.97 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.21 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  36.51 
 
 		 422 aa  256  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  42.58 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.48 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.22 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 407 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  42.42 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>