More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0559 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
420 aa  870    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  56.77 
 
 
407 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  55.42 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  50.6 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  55.66 
 
 
410 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  47.26 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  52.25 
 
 
413 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  48.93 
 
 
407 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  48.67 
 
 
407 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  48.67 
 
 
407 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  47.06 
 
 
415 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  44.76 
 
 
428 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  47.02 
 
 
409 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  42.96 
 
 
406 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  43.99 
 
 
455 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  45.19 
 
 
402 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  45.71 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  43.51 
 
 
453 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  50.27 
 
 
369 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  42.07 
 
 
432 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  43.78 
 
 
411 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  43.68 
 
 
385 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
423 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  40.65 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
408 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  42.38 
 
 
417 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  44.06 
 
 
518 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  39.67 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  43.26 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 
460 aa  302  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  41.49 
 
 
437 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 
406 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
412 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  36.82 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
412 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
406 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
390 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  31.67 
 
 
401 aa  213  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  30.08 
 
 
412 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
406 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  45.97 
 
 
188 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  45.97 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.22 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.73 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.82 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  30.77 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.5 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.26 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.36 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  26.23 
 
 
364 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.27 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
379 aa  63.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.64 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  26.44 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
426 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
359 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
500 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.74 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
374 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.54 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
385 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.34 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
762 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.7 
 
 
362 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.31 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.35 
 
 
407 aa  59.7  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>