More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0249 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0249  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 410 aa  787    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  30.95 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.4 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  29.15 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  29.15 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 		 422 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  29.44 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  29.85 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  29.59 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  27.44 
 
 		 428 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.44 
 
 		 464 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  25.94 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 418 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 425 aa  142  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  27.39 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  29.34 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  30.69 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  26.25 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  29.5 
 
 		 418 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  24.81 
 
 		 421 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  26.84 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  28.87 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  28.95 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  29.57 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  26.4 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  31.22 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  29.81 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 		 450 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  29.82 
 
 		 442 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  26.52 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  26.52 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  26.65 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  26.27 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  25.82 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 444 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  26.93 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  32.26 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  27.7 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  27.37 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  26.14 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  29.23 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  30.37 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  27.53 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  27.53 
 
 		 431 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  33.51 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  32.83 
 
 		 435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  32.82 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  29.02 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 		 424 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 		 422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.98 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 438 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  30.37 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  32.73 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  27.78 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>