More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1316 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  58.97 
 
 
238 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  60.09 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  57.69 
 
 
232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  57.94 
 
 
233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  56.84 
 
 
232 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  58.37 
 
 
232 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  56.84 
 
 
232 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  56.41 
 
 
232 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  54.51 
 
 
231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  58.62 
 
 
243 aa  265  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  57.69 
 
 
232 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  57.26 
 
 
232 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  58.8 
 
 
233 aa  264  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  57.94 
 
 
232 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  57.51 
 
 
232 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  58.55 
 
 
232 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  57.94 
 
 
231 aa  259  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  58.37 
 
 
232 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  56.65 
 
 
232 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  56.22 
 
 
232 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  57.08 
 
 
232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  54.51 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  54.89 
 
 
234 aa  247  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  55.36 
 
 
232 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  54.27 
 
 
236 aa  238  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  50 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  48.51 
 
 
232 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  47.01 
 
 
229 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  42.31 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  42.31 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  39.45 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  40.51 
 
 
235 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  45.69 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  41.88 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  41.23 
 
 
232 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  44.87 
 
 
236 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  41.74 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  44.87 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  41.23 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  41.23 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  41.23 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  44.02 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  44.65 
 
 
235 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  41.23 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  44.87 
 
 
232 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  44.02 
 
 
232 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  41.23 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  40.97 
 
 
232 aa  181  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  41.23 
 
 
232 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  44.02 
 
 
235 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  42.86 
 
 
238 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  44.68 
 
 
234 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  39.47 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  41.26 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  41.45 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  41.88 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  39.83 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  41.63 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  40.17 
 
 
231 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  40.17 
 
 
231 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  40.17 
 
 
231 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  40.17 
 
 
231 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  40.17 
 
 
231 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  39.74 
 
 
231 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  39.74 
 
 
231 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  38.89 
 
 
231 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  42.98 
 
 
234 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  37.87 
 
 
234 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  40.35 
 
 
232 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  39.74 
 
 
231 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  38.46 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  40.6 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  35.59 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  38.46 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  40.85 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  40.43 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  40.17 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  37.61 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  40.17 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  40 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  38.89 
 
 
231 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1676  Pirin-like  38.72 
 
 
231 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.192961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 
231 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  38.46 
 
 
231 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  38.46 
 
 
231 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  38.46 
 
 
231 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000958  pirin-related protein  38.3 
 
 
231 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  40 
 
 
241 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  38.1 
 
 
233 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  38.1 
 
 
233 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  39.41 
 
 
241 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>