More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1140 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1140  ABC transporter related  100 
 
 		 524 aa  1019    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  40.48 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  40.48 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.83 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  45.6 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  43.11 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 		 516 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.51 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  44.16 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  44.49 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  39.2 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.03 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.59 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  41.07 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.97 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43 
 
 		 513 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  42.16 
 
 		 510 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  44.58 
 
 		 509 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  44.38 
 
 		 504 aa  361  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.11 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  42.8 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.44 
 
 		 512 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.6 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.73 
 
 		 514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.77 
 
 		 512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.77 
 
 		 512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.34 
 
 		 499 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.87 
 
 		 517 aa  356  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  41.75 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.94 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 		 522 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.35 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.6 
 
 		 500 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 497 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 500 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 520 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.09 
 
 		 503 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 		 525 aa  349  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  36.84 
 
 		 494 aa  349  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  43.45 
 
 		 500 aa  349  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 525 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.03 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.94 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.07 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 500 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.48 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40.16 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  42.89 
 
 		 521 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 501 aa  346  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  38.82 
 
 		 494 aa  346  6e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 504 aa  346  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 511 aa  345  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.55 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.15 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.18 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  38.55 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  42.71 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2594  ABC transporter related  41.76 
 
 		 493 aa  345  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  41.97 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  39.84 
 
 		 511 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.98 
 
 		 519 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.86 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.69 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  38.09 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  42.38 
 
 		 524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.12 
 
 		 861 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.97 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.22 
 
 		 504 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.2 
 
 		 516 aa  343  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.16 
 
 		 502 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  39.92 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  41.41 
 
 		 528 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.82 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  41.36 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.36 
 
 		 501 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 		 518 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.72 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  42.01 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  41.96 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  41.85 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.08 
 
 		 501 aa  340  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  41.63 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  41.63 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  41.63 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.96 
 
 		 515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>