More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4332 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 		 462 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.96 
 
 		 475 aa  634    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  67.58 
 
 		 530 aa  641    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.46 
 
 		 470 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 475 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 476 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 		 467 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 		 462 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 		 467 aa  666    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 464 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.28 
 
 		 462 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.84 
 
 		 476 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.06 
 
 		 473 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  67.16 
 
 		 547 aa  640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 		 474 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 476 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.4 
 
 		 481 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 472 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 468 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 468 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 		 482 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 472 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 		 462 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 		 482 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.46 
 
 		 470 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.91 
 
 		 470 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.81 
 
 		 474 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 		 462 aa  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.61 
 
 		 482 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  68.49 
 
 		 479 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.04 
 
 		 481 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  66.88 
 
 		 501 aa  644    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  68 
 
 		 471 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 474 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.6 
 
 		 464 aa  639    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.18 
 
 		 476 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 		 464 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 		 462 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  67.09 
 
 		 465 aa  642    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.08 
 
 		 471 aa  693    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  66.46 
 
 		 468 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.5 
 
 		 474 aa  653    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4332  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 480 aa  972    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551629  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.62 
 
 		 474 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.21 
 
 		 471 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 478 aa  636    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.98 
 
 		 487 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 519 aa  634    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.55 
 
 		 470 aa  634    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.34 
 
 		 465 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.34 
 
 		 465 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 475 aa  637    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 484 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 465 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 		 482 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 		 476 aa  634    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.92 
 
 		 493 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 		 472 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  70.32 
 
 		 503 aa  658    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  66.39 
 
 		 481 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.98 
 
 		 475 aa  658    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 		 470 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 		 470 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.11 
 
 		 469 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.62 
 
 		 471 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 471 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 		 462 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 474 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 475 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 		 484 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 475 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 473 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 		 473 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.18 
 
 		 476 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.18 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  64.35 
 
 		 482 aa  633  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 		 463 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 462 aa  631  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  65.04 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.03 
 
 		 477 aa  629  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.97 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.92 
 
 		 482 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.54 
 
 		 478 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  66.06 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.55 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 480 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.4 
 
 		 474 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.04 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>